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以iTRAQ技术为代表的体外标记技术是目前应用较为广泛的蛋白质组学半定量检测技术,其操作简单,数据稳定性高。然而,受到同位素标签数量的限制,在进行大批样品实验时,以Label Free和DIA为代表的非标记定量蛋白质组学技术则具有更多优势,详细信息见子网页。
通过对比分析组间定量蛋白质组学数据的差异,研究人员发现衰老是引起蛋白质组变化的重要因素。而在高脂环境下,衰老对于蛋白质组的调变影响将被放大,表现为代谢相关差异蛋白显著增多。
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SILAC和iTRAQ/TMT技术的蛋白通量要高于Label Free,相对应的价格也要比Label Free高一点;Label Free技术与SILAC和iTRAQ/TMT技术相比,其通量要低一些,性价比要高一些。通常来说,如果样品数量少于10个,可以使用传统的DDA定量方法,因为样品数量较少,可以在一次实验中同时处理,得到的结果准确,性价比较高,而对于大批量样品或者多批次实验的重现性会有一些影响。蛋白质组研究分析中心(RCPA)于2000年在中国科学院上海生命科学研究院和生物化学与细胞生物学研究所的共同支持下诞生。RCPA拥有国际上一流的蛋白质组学实验设备,一流的科研队伍及技术依托平台,使中心在蛋白质组学研究领域中成绩斐然。中心在国内率先建立了高通量的蛋白质组学研究技术平台,开展了重大疾病
蛋白质组学的研究试图比较细胞在不同生理或病理条件下蛋白质表达的异同,对相关蛋白质进行分类和鉴定。更重要的是蛋白质组学的研究要分析蛋白质间相互作用和蛋白质的功能。
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