惠州病理_文奇生物动手动脑,探求规律
病理,磷酸化蛋白质组学及位点修饰鉴定
技术简介
蛋白质磷酸化修饰是生物体内最重要的共价修饰方式之一。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程调节着包括细胞增殖、发育、分化、信号转导、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩及肿瘤发生等过程在内的所有生命活动。在哺乳动物细胞生命周期中,大约有1/3的蛋白质发生着磷酸化修饰。 蛋白质磷酸化可以发生在多种氨基酸上,其中以丝氨酸 (S) 最多、苏氨酸 (T)次之、酪氨酸 (Y) 相对较少。(1) 利用金属氧化物TiO2或者金属螯合柱IMAC对磷酸基团的亲和能力可以实现对含有S, T, Y磷酸化肽段的富集,(2) 利用高亲和力酪氨酸磷酸化基序抗体可以特异性富集酪氨酸磷酸化肽段。上述两种富集方式结合LC-MS/MS蛋白质定量的方法,实现大规模磷酸化蛋白质定性定量分析。
技术优势
深度分析:一次性检测>25000个磷酸化修饰位点
结果验证:可基于PRM技术对定量结果进行验证
多角度分析:提供磷酸化修饰组+代谢组等多组学联合分析
质量与经验:国内提供磷酸化修饰组学分析服务的平台
多组学分析:可与代谢组学联合分析,提供机制—表型方向的研究路线
客户提供
需鉴定的样品
样品信息单:详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。
数据分析
1. 蛋白质鉴定列表,肽段鉴定定量列表,修饰位点鉴定定量列表,KEGG通路注释统计表,GO功能列表,KEGG信号通路Mapping表。
2. 层次聚类热图(cluster),COG/KOG分析,修饰位点统计绘图,GO功能富集图及富集分析,KEGG通路图及富集分析,蛋白质互作网络分析,保守motif分析,互作网络Module分析。
参考文献
1. Quantitative phosphoproteomic and metabonomic analyses reveal GmMYB173 optimizes flavonoid metabolism in soybean under salt stress. MCP. 2018
iTRAQ磷酸化-研究GmMYB173转录因子优化盐胁迫下大豆黄酮类代谢调控机理。
2. Quantitative Phosphoproteomic Analysis among Muscles of Different Color Stability using Tandem Mass Tag Labeling. Food Chemistry. 2018
TMT磷酸化-绵羊-肌红蛋白磷酸化蛋白调控羊肉肉色稳定性
3. Label-free quantitative phosphoproteomic profiling of cellular response induced by an insect cytokine paralytic peptide. J Proteomics. 2017
label-free-磷酸化-家蚕脂肪体组织-研究家蚕麻痹肽信号关键调控因子
原文标题:惠州病理_文奇生物动手动脑,探求规律
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