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案例分析

 

案例1：拟南芥花叶根组织m6A RNA甲基化谱

 

原文：Transcriptome-wide high-throughput deep m6 A-seq reveals unique differential m6 A methylation patterns between three organs in Arabidopsis thaliana

 

期刊：Genome Biology 影响因子：13.21

 

西北农林科技大学联合中科院和普渡大学，借助m6A RNA甲基化测序技术，对比拟南芥花，叶，根组织中（每种组织有两个生物学重复）m6A RNA甲基化情况。结果发现检测组织中m6A RNA甲基化修饰程度比人类高10%左右，占转录组的83%。

 

案例2：不同品系拟南芥m6A RNA甲基化谱

 

原文：Unique features of the m6A methylome in Arabidopsis thaliana

 

期刊：Nature communications 影响因子：12.12

 

芝加哥大学联合北大，利用m6A RNA甲基化测序对比和品系拟南芥根组织中m6A RNA甲基化谱，发现的分布在两个品种间高度保守。与人类m6A RNA甲基化位点分布情况相比，拟南芥甲基化位点在起始翻译区特异性高表达。

 

案例3：m6A RNA去甲基化酶ALKBH5通过结合lncRNA促进胶质瘤细胞

 

原文：m6A Demethylase ALKBH5 Maintains Tumorigenicity of Glioblastoma Stem-like Cells by Sustaining FOXM1 Expression and Cell Proliferation Program 

 

期刊：Cancer Cell 影响因子：27.43 

 

世界卫生组织将胶质瘤分为四级，其中恶性胶质瘤(GBM)属于极危险的第四级，手术治疗和化疗都难以避免其高复发率。近年来，m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域前沿研究之一，不断有高分文章问世。m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰，此时人们更关心m6A RNA修饰与重大疾病之间的相关性。近期Cancer Cell报道了m6A RNA去甲基化酶ALKBH5在神经胶质瘤中具有生理作用。在本研究中，去甲基化酶ALKBH5在恶性胶质瘤干性样细胞表达上调，而ALKBH5高表达的胶质细胞瘤患者预后生存率更差。通过敲低ALKBH5，meRIP鉴定m6A RNA甲基化修饰模式，基因芯片检测差异表达>2倍的基因，终筛选到与细胞周期调控相关的FOXM1基因，其在GSCs的自我修复和肿瘤形成中起到关键作用。ALKBH5促使癌基因FOXM1转录本去甲基化，增加FOXM1表达。随后作者发现FOXM1反义长链非编码RNA——FOXM1-AS(LOC100507424)，与FOXM1 mRNA外显子有457个核苷酸互补。结果证实ALKBH5和FOXM1-AS可与FOXM1协同作用，发挥促进恶性胶质瘤肿瘤形成作用。 

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