广州CHIP_文奇生物以医疗芯数据，引领医学实验室大未来

案例解析

 

案例1：m6A调控环状RNA编码蛋白质

 

原文：Extensive translation of circular RNAs driven by N6-methyladenosine

 

期刊：Cell Research 影响因子：15.60

 

这篇文章出自中科院王泽峰团队，证实发生大量的环形RNA可作为mRNA来编码蛋白，这些环形mRNA通过m6A RNA甲基化修饰驱动非帽依赖性的翻译机制来参与蛋白编码过程。该研究进一步拓展了环装RNA的功能，对蛋白质的来源的多样性有新的认识，具有十分重要的理论意义。作者借助RIP测序技术，发现与mRNA相比，m6A甲基化修饰在环状RNA上更普遍。

 

案例2：环状RNA普遍存在m6A修饰且呈现细胞特异性

 

原文：Genome-Wide Maps of m6A circRNAs Identify Widespread and Cell-Type-Specific Methylation Patterns that Are Distinct from mRNAs

 

期刊：Cell Reports 影响因子：8.03

 

本文通过高通量测序方法检测到Hela细胞和hESC细胞m6A RNA甲基化谱，发现环状RNA在两类细胞中普遍存在。通过生信分析，对比两种细胞共有及特有的环状RNA并通过验证手段（Sanger测序）验证成环状位置的序列。

 

m6A LncRNA测序

 

产品详情

 

技术简介

 

近年来，科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A，即RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰（N6-methyladenosine，m6A）。研究发现，m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰， m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译，在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。

 

目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术，文奇生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务，技术原理如下： 将甲基化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本只含有打断的RNA片段，并不添加RNA甲基化特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。对比免疫共沉淀(IP)样本和对照样本（Input）中的序列片段，将RNA甲基化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中RNA甲基化程度。

 

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